Согласно традиции, монастырь был основан в конце IV века императором Феодосием I в благодарность Богородице за спасение сына императора, который, будучи еще малолетним (paidion), путешествовал по морю, потерпел кораблекрушение у берегов Афона и был чудесным образом вынесен на берег к кусту (vatos), почему монастырь и получил название “ Vato-paidion”.В X веке монастырь был реконструирован тремя знатными вельможами: Афанасием, Николаем и Антонием, и в таком виде сохранился до наших дней. 

Основание Ватопеда относится ко времени Константина Великого. В середине lX века после нападения арабов на Святую Гору, Ватопед был разорен. В Х веке по совету преподобного Афанасия Афонского Ватопед обновили трое богатых мирян. Сами устроители впоследствии приняли монашество в обновленной ими обители. Ватопед- один из самых старых и больших монастырей Святой Горы. Он находится среди фруктовых садов и виноградников на северо-восточном склоне Святой Горы, на берегу залива Контессо. С трех других сторон монастырь окружен горами, покрытыми густым лесом из кедров, сосен, пихт, дубов, кипарисов и маслин.

По количеству реликвий Ватопед считается первым монастырем на Афоне. В их числе одна из главных святынь православия- Пояс Богородицы, а также яшмовая чаша, дарованная обители византийским императором Мануэлем II Палеологом, способная обращать воду в противоядие от змеиных укусов и часть тростника, на котором Христу поднесли губку с уксусом во время Распятия. Также сюда приходят поклониться частице Животворящего Креста Господня, мощам целителя Пантелеймона и многочисленным образам Богородицы, из которых восемь считаются чудотворными. Ватопед приспел и в виноделии. Гармоничное сочетание ягод и фруктов говорит о изысканности ватопедского вина.